MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Candidatus Sulcia muelleri str. Sulcia-ALF

Total Repeats: 304

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_021916	T	8	8	11	18	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_021916	ATG	2	6	3339	3344	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3	NC_021916	A	8	8	3388	3395	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_021916	ATTAA	2	10	10823	10832	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_021916	TAA	2	6	10836	10841	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_021916	T	7	7	11597	11603	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_021916	A	6	6	11604	11609	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_021916	TATATT	2	12	11617	11628	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_021916	TCG	2	6	11651	11656	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10	NC_021916	CTA	2	6	11698	11703	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11	NC_021916	AATAT	2	10	16426	16435	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_021916	TA	4	8	16443	16450	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_021916	T	8	8	16456	16463	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_021916	A	9	9	22605	22613	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_021916	TAT	2	6	28715	28720	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_021916	TA	3	6	28725	28730	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_021916	AAT	2	6	28747	28752	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_021916	TAA	2	6	28757	28762	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_021916	TAA	2	6	32864	32869	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_021916	T	6	6	36356	36361	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_021916	TAT	2	6	36374	36379	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_021916	TA	3	6	36383	36388	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_021916	AT	3	6	36391	36396	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_021916	AT	3	6	36400	36405	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_021916	TTA	2	6	36416	36421	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_021916	T	9	9	36429	36437	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_021916	T	10	10	36446	36455	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_021916	ATTTGA	2	12	41336	41347	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
29	NC_021916	T	6	6	41366	41371	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_021916	T	7	7	47172	47178	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_021916	A	6	6	47185	47190	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_021916	TAAA	2	8	47203	47210	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_021916	TAAT	2	8	47214	47221	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_021916	TAT	2	6	47242	47247	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_021916	AT	4	8	47246	47253	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_021916	ATTTT	2	10	47262	47271	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_021916	TTAAT	2	10	47279	47288	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_021916	TATTAG	2	12	47289	47300	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
39	NC_021916	GGT	2	6	47305	47310	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
40	NC_021916	A	8	8	48575	48582	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_021916	AAGA	2	8	48632	48639	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
42	NC_021916	CTAC	2	8	48722	48729	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
43	NC_021916	TGG	2	6	48745	48750	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
44	NC_021916	CTA	2	6	48888	48893	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
45	NC_021916	AC	3	6	48907	48912	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
46	NC_021916	A	6	6	48924	48929	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_021916	A	10	10	48937	48946	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_021916	ATT	2	6	49406	49411	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_021916	TTTA	2	8	49412	49419	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_021916	A	6	6	49419	49424	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_021916	ATTAT	2	10	49427	49436	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_021916	TA	3	6	49437	49442	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_021916	AAT	2	6	49443	49448	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_021916	AT	3	6	49447	49452	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_021916	A	10	10	49468	49477	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_021916	A	6	6	49481	49486	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_021916	AAT	2	6	49508	49513	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_021916	GCA	2	6	49623	49628	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
59	NC_021916	ATT	2	6	49635	49640	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_021916	ATAC	2	8	49667	49674	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
61	NC_021916	ATA	2	6	49727	49732	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_021916	T	6	6	49736	49741	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_021916	AGAA	2	8	49742	49749	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
64	NC_021916	TAT	2	6	49765	49770	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_021916	TTAG	2	8	49795	49802	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
66	NC_021916	GGTAA	2	10	49805	49814	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
67	NC_021916	GAT	2	6	49829	49834	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
68	NC_021916	GGA	2	6	49928	49933	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
69	NC_021916	GAAA	2	8	49965	49972	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
70	NC_021916	A	6	6	50008	50013	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_021916	AAT	2	6	50027	50032	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_021916	CAG	2	6	50072	50077	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
73	NC_021916	AGT	2	6	50153	50158	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
74	NC_021916	TG	3	6	50230	50235	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
75	NC_021916	CA	3	6	50261	50266	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
76	NC_021916	GAT	2	6	50371	50376	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
77	NC_021916	ACTA	2	8	50378	50385	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
78	NC_021916	GTG	2	6	50410	50415	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
79	NC_021916	GAG	2	6	50442	50447	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
80	NC_021916	GAT	2	6	50520	50525	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
81	NC_021916	TAC	2	6	50555	50560	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
82	NC_021916	TGC	2	6	50603	50608	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
83	NC_021916	GTC	2	6	50615	50620	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
84	NC_021916	TTA	3	9	50670	50678	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_021916	TAA	2	6	50707	50712	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_021916	ATC	2	6	50755	50760	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
87	NC_021916	CA	3	6	50781	50786	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
88	NC_021916	AC	3	6	50951	50956	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
89	NC_021916	TAA	2	6	51017	51022	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_021916	A	6	6	51118	51123	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_021916	ACT	2	6	51209	51214	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
92	NC_021916	TCC	2	6	51296	51301	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
93	NC_021916	TAA	2	6	51305	51310	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_021916	AAG	2	6	51314	51319	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
95	NC_021916	TGG	2	6	51326	51331	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
96	NC_021916	GA	3	6	51345	51350	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
97	NC_021916	AATT	2	8	51389	51396	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_021916	AACT	2	8	51417	51424	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
99	NC_021916	AAT	3	9	51426	51434	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_021916	A	9	9	51493	51501	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_021916	GCG	2	6	51522	51527	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
102	NC_021916	AGA	2	6	51537	51542	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
103	NC_021916	ATAGA	2	10	51593	51602	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
104	NC_021916	A	7	7	51611	51617	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_021916	ATTA	2	8	51645	51652	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_021916	A	6	6	51652	51657	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_021916	AGA	2	6	51799	51804	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
108	NC_021916	A	6	6	51850	51855	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_021916	ACG	2	6	51859	51864	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
110	NC_021916	AAT	2	6	51912	51917	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_021916	GGA	2	6	52031	52036	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
112	NC_021916	GCA	2	6	52139	52144	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
113	NC_021916	TAT	2	6	52156	52161	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_021916	TAG	2	6	52243	52248	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
115	NC_021916	AAC	2	6	52286	52291	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
116	NC_021916	TA	3	6	52318	52323	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_021916	GAA	2	6	52331	52336	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
118	NC_021916	AGC	2	6	52378	52383	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
119	NC_021916	TAGTT	2	10	52414	52423	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
120	NC_021916	ATA	2	6	52435	52440	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_021916	TA	3	6	52453	52458	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_021916	TAA	2	6	52498	52503	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_021916	TA	3	6	52698	52703	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_021916	TGA	2	6	52717	52722	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
125	NC_021916	TAT	2	6	52800	52805	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_021916	AAC	2	6	52858	52863	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
127	NC_021916	TAA	2	6	52864	52869	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_021916	A	6	6	52898	52903	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_021916	AGG	2	6	53146	53151	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
130	NC_021916	CGG	2	6	53192	53197	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
131	NC_021916	GTA	2	6	53308	53313	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
132	NC_021916	GTA	2	6	53402	53407	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
133	NC_021916	ACC	2	6	53463	53468	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
134	NC_021916	TTTA	2	8	53470	53477	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_021916	GTG	2	6	53513	53518	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
136	NC_021916	GGT	2	6	53533	53538	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
137	NC_021916	GGT	2	6	53677	53682	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
138	NC_021916	GAA	2	6	53810	53815	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
139	NC_021916	CGT	2	6	53872	53877	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
140	NC_021916	TCTA	2	8	53892	53899	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
141	NC_021916	GATAA	2	10	54013	54022	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
142	NC_021916	CTT	2	6	54065	54070	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
143	NC_021916	AGT	2	6	54136	54141	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
144	NC_021916	CAA	2	6	54201	54206	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
145	NC_021916	A	8	8	54303	54310	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
146	NC_021916	TAC	2	6	58414	58419	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
147	NC_021916	CAA	2	6	58463	58468	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
148	NC_021916	TGG	2	6	58476	58481	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
149	NC_021916	TAT	2	6	60062	60067	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
150	NC_021916	TA	3	6	60099	60104	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
151	NC_021916	AAT	2	6	60110	60115	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
152	NC_021916	A	11	11	62005	62015	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
153	NC_021916	AAT	2	6	62018	62023	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
154	NC_021916	A	6	6	62036	62041	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
155	NC_021916	TAA	2	6	62059	62064	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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157	NC_021916	TA	3	6	64042	64047	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
158	NC_021916	AAATT	2	10	69510	69519	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
159	NC_021916	AT	4	8	69535	69542	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
160	NC_021916	T	6	6	72184	72189	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
161	NC_021916	AAT	2	6	72190	72195	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
162	NC_021916	CA	3	6	88084	88089	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
163	NC_021916	CTGG	2	8	88141	88148	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
164	NC_021916	GTCAT	2	10	88207	88216	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
165	NC_021916	ATA	2	6	88228	88233	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
166	NC_021916	T	7	7	88234	88240	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
167	NC_021916	AT	3	6	88252	88257	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
168	NC_021916	TGC	2	6	97154	97159	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
169	NC_021916	T	6	6	97182	97187	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
170	NC_021916	TAAT	2	8	97189	97196	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
171	NC_021916	TATT	2	8	97204	97211	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
172	NC_021916	TGC	2	6	100918	100923	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
173	NC_021916	A	6	6	100946	100951	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
174	NC_021916	CT	3	6	100970	100975	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
175	NC_021916	ATATA	2	10	100986	100995	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
176	NC_021916	TAT	2	6	103872	103877	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
177	NC_021916	AT	3	6	113196	113201	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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182	NC_021916	TTA	2	6	115729	115734	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
183	NC_021916	ATT	2	6	115737	115742	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
184	NC_021916	T	6	6	115840	115845	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
185	NC_021916	CTT	2	6	115849	115854	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
186	NC_021916	T	7	7	115853	115859	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
187	NC_021916	T	14	14	115877	115890	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
188	NC_021916	T	8	8	115892	115899	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
189	NC_021916	AT	3	6	115909	115914	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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191	NC_021916	TA	3	6	115927	115932	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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193	NC_021916	TAT	2	6	121452	121457	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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195	NC_021916	TC	3	6	122911	122916	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
196	NC_021916	A	6	6	122922	122927	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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198	NC_021916	ATT	2	6	123027	123032	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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208	NC_021916	TAT	2	6	127655	127660	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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281	NC_021916	T	7	7	177779	177785	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
282	NC_021916	T	6	6	177821	177826	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
283	NC_021916	AT	3	6	177835	177840	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
284	NC_021916	TCA	2	6	177871	177876	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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287	NC_021916	T	6	6	177938	177943	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
288	NC_021916	TTA	2	6	177951	177956	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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291	NC_021916	T	7	7	177983	177989	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
292	NC_021916	A	6	6	178008	178013	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
293	NC_021916	AT	3	6	178018	178023	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
294	NC_021916	TGAT	2	8	178055	178062	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
295	NC_021916	TAA	2	6	178094	178099	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
296	NC_021916	TTTAGT	2	12	178100	178111	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
297	NC_021916	GATTA	15	75	178127	178201	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
298	NC_021916	AGTA	2	8	178216	178223	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
299	NC_021916	AGT	2	6	182506	182511	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
300	NC_021916	ATT	2	6	182531	182536	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
301	NC_021916	AAATTA	2	12	182537	182548	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
302	NC_021916	ATT	2	6	186024	186029	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
303	NC_021916	T	7	7	186040	186046	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
304	NC_021916	TTTA	2	8	186049	186056	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.